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RNA interference (RNAi) is a process of gene silencing achieved by introducing short strands of RNA into a cell, which can have profound effects on the function of that cell.

The term RNAi was first coined in 1998, by Andrew Fire and Craig Mello, who described its ability to induce gene silencing. They were, at that time, working independently on RNA-directed gene silencing, which differs from the more recently discovered phenomenon of microRNA-mediated gene regulation.

RNAi, microRNA and siRNA

The recently discovered phenomenon of microRNA-mediated gene regulation is distinct from RNAi, but is widely thought to be related to and may depend on it.

Genome-wide siRNA libraries containing multiple siRNAs, including passenger and guide strands, or even multiple siRNAs per gene, are generated in vitro. These siRNA libraries are often augmented with sgRNAs, which possess genetic markers to allow gene knockout and cause a phenotype when bound and cleaved by the Cas9 enzyme. siRNA libraries and sgRNA libraries are commonly used in vitro to study gene function and genetic interactions. They are used in vivo to silence genes in human cell lines and animals, both for research purposes and for therapeutic use.

Gene silencing

Genes are often silenced in the cell using double-stranded RNA. There are two classes of small RNAs that can act to silence genes, microRNAs and short interfering RNAs (siRNAs). In 2008, two groups demonstrated that RNA interference can occur in plants. However, RNA interference in plants has not been studied in depth since then. There is no evidence that RNA interference exists in any animal species outside of C. elegans.

The canonical RNAi pathway involves the generation of siRNA from long double-stranded RNA (dsRNA). In the cytoplasm, an enzyme called Dicer processes

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